ピストン、ピストンリング、シリンダーの摩耗によるオイル上がり、バルブガイドのがた、バルブステムシールの摩耗によるオイル下がりなどは大きな出力低下の原因です。
またシリンダーの摩耗が大きい場合、ピストンとピストンリングから燃焼行程時に燃焼ガスが吹きぬけてしまい、クランクケースに流れ込んでしまいます。 そうなる事でエンジンオイルを早く傷める要因となり、エンジンオイルとしての役割を果たす事が出来なくなります。 そこからは悪循環の始まりです。
もともと空冷エンジンですから、オイル管理はとてもシビアです。ホンダ指定の10W-40のオイルでも注意が必要です。むしろXR250の場合は、10W-50もしくは10W-60でも良いと思います。
オイルの役割を果たせなくなったオイルが、エンジンの中を循環したらどんどん部品が消耗して異音がが出てくるのは当たり前です。 こうなる前に適切なエンジンのオーバーホールが必要と言えます。